Abstract
- Das Projekt soll im Rahmen einer Kooperation mit dem UFZ Leipzig, Proteomics, durchgeführt werden. Ziel ist es auf der Grundlage von experimentellen Daten aus Affinitätsaufreinigungen mit anschließender Massenspektrometrie (AP-MS) Protein-Protein-Komplexe zu detektieren und diese in Protein-Protein-Interaktions-Netzwerken (PPIN) darzustellen. PPIN’s sind notwendig, um ein Verständnis von biologischen Funktionen und intermolekularen Komplexbildungen zu erhalten. Das Verständnis von Interaktionen bildet die Grundlage für das Verständnis von Krankheitsbildern. Fokus des Projektes ist die Entwicklung einer Software für die Auswertung von AF-MS Daten. Für dieses Projekt stehen dem Antragsteller verschiedene experimentelle Datensätze zur Verfügung. Neben der Softwareentwicklung sollen strukturelle Interaktionsnetzwerke entwickelt werden, die ein direktes Verständnis der Interaktionen auf molekularer Ebene ermöglichen und ein korrektes Bild der Wechselwirkungen bzw. Störungen wiedergeben. Die Netzwerke werden mit Daten aus öffentlichen biologischen Datenbanken angereichert und erlauben so Homologiebetrachtungen und Rückschlüsse auf Krankheitsbilder.