Diese umfangreich erweiterte dritte Auflage bietet eine praktische Einführung in BioData Science. Mit einem praxisorientierten Lernansatz bietet dieses Buch reichlich Gelegenheit zum Üben:

- Installation und Nutzung von Linux als virtuelle Maschine oder per Fernzugriff
- Verarbeitung von Biodaten mit der Programmiersprache AWK
- Verwalten von Daten mit dem relationalen Datenbanksystem MariaDB
- Analysieren und Visualisieren von Daten mit R
- Implementierung guter bioinformatischer Praktiken mit Jupyter Notebook und GitHub

Dieses Buch richtet sich sowohl an Studenten als auch an Fachleute in den Biowissenschaften. Es richtet sich zwar an Anfänger, enthält aber auch wertvolle Tipps und Tricks für erfahrene Forscher, die mit großen Datensätzen arbeiten.

Anhand von Arbeitsbeispielen wird gezeigt, wie man verschiedene Bioinformatik-Tools wie BLAST, Clustal, PLINK, IGV, SAMtools, BCFtools, Mason2, Minimap, NCBI Datasets, Velvet, Jmol und andere einsetzen kann:

- Identifizierung von bakteriellen Proteinen, die möglicherweise mit der Pathogenität in Verbindung stehen
- Abfragen molekularer Strukturen für redox-regulierte Enzyme
- Mapping und Assemblierung echter oder simulierter Sequenzdaten
- Identifizierung und Kartierung von Molekularstrukturmutationen in Viren
- Durchführung von genomweiten Assoziationsstudien

Alle genannten Software-Tools und Datensätze sind frei verfügbar, und der gesamte Code ist als Jupyter Notebooks auf GitHub zugänglich. Dieses Buch basiert auf den Erfahrungen und dem Wissen des Autors, das er sowohl im akademischen Bereich als auch in der Industrie gesammelt hat, und bietet einen praktischen und umfassenden Ansatz für die Bioinformatik.