Wünschiers, Röbbe

Prof. Dr. rer. nat. habil.

Positionen

Professor, Fachgruppe Biotechnologie und Chemie, Fakultät Angewandte Computer- und Biowissenschaften

Über mich

I love processing of biological data with AWK. Hence, you can find me in the Web under awkologist.com and in Instagram as the.awkologist.

Forschungsgebiete

- Elucidation of ecological networks by pollen DNA analysis
- Analysis of bee health based on landscape diversity and agricultural practices
- Support of varroa-resistant bee breeding with genomic diagnostics
- Development of a gene-test for chryptorchidism in dogs
- Engineering of an efficient hydrogen-producing bacterial chassis by gene editing

Forschungsschwerpunkt

Produkt- und Prozessentwicklung Forschungsschwerpunkt

Projektleitung

Innovationscluster HSMW 2023, AP08: Assemblierung des Schafpudel-Genoms und genomweite Assoziationsstudien zu Kryptorchismus mit dem Ziel der Entwicklung eines Testverfahrens finanziert durch Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2023 - 2026
Gesundheit solitärer Wildbienen in Abhängigkeit von Landschaftsvielfalt, landwirtschaftlichen Praktiken und des Pollenangebot finanziert durch Deutsche Forschungsgemeinschaft 2023 - 2026
Innovationsvorhaben zur Profilschärfung 2022, AP 4.13 Gendiagnostische Nutzung der genetischen Biodiversität beim Schafpudel, einem Hütehund der ostdeutschen Tiefebene finanziert durch Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2022
Innovationscluster HSMW 2020, AP 4: Entwicklung eines Bewertungsverfahrens für die Vitalität von Bestäubern in Agrarflächen mithilfe eines mobilen genetischen Biodiversität-Tests finanziert durch Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2020 - 2022
Nachwuchsforschergruppe MaLeKITA Maschinelles Lernen und KI in Theorie und Anwendungen, MaLeKITA Anwendungen Technik finanziert durch Sächsische Aufbaubank 2020 - 2022
Saxony5 - TV 7 CCL7 Landwirtschaft und Biodiversität finanziert durch Bundesministerium für Bildung und Forschung 2018 - 2022
Identifikationssicherheit und BigData in den Computer- und Biowissenschaften, AP 4: Identifikation von Pathogenen finanziert durch Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2016 - 2017
CyanoFactory - Design, Construction and Demonstration of solar Biofuel Production using novel (photo)synthetic Cell Factories finanziert durch Europäische Union 2012 - 2016
Lichtgetriebene Wasserstoff-Erzeugung mit Rhodobacter sphaeroides - Analyse der beteiligten Elemente finanziert durch Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2014
Verbundprojekt Biomathematik/Bioinformatik/Molekularbiologie, Teilprojekt Zeitreihenanalyse der Genexpression bei Escherichia coli zur Validierung von RNA-Seq Daten und in Hinblick auf dessen Verwendung als biotechnologisches Chassis finanziert durch Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2013 - 2014
Zeitreihenanalyse finanziert durch Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2013
Biomathematik/Bioinformatik/Molekularbiologie finanziert durch Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2012 - 2013
Protein-Protein-Interaction for Cancer Research finanziert durch Janssen Pharmaceutica N.V. 2011 - 2013

Projektmitgliedschaft

Klassifikationssicherheit in angewandten Computer- und Biowissenschaften finanziert durch Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2015 - 2016

ausgewählte Publikationen

Beitrag in nicht-wissenschaftlichen Medien
- Die genetische Diversität von Ökosystemen erfassen. ZEIT ONLINE. 2022
Journalartikel
- Analysis of a σ54 Transcription Factor L420P Mutation in Context of Increased Organic Nitrogen Tolerance of Photofermentative Hydrogen Production in Cereibacter sphaeroides Strain 2.4.1 Substrain H2. Synthetic Biology and Engineering. 2024
- A primer on pollen assignment by nanopore-based DNA sequencing. Frontiers in Ecology and Evolution. 2023
- Testing assembly strategies of Francisella tularensis genomes to infer an evolutionary conservation analysis of genomic structures. BMC Genomics. 822. 2021
- Analyzing the Dietary Diary of Bumble Bee. Frontiers in Plant Science. 2020
- Benchmarking the MinION: Evaluating long reads for microbial profiling. Scientific Reports. 5125. 2020
- Draft Genome Assembly of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 Substrain H2 from Nanopore Data. Microbiology Resource Announcements. 2020
- Using ITS2 metabarcoding and microscopy to analyse shifts in pollen diets of honey bees and bumble bees along a mass‐flowering crop gradient. Molecular Ecology. 5003-5018. 2020
- CyanoFactory, a European consortium to develop technologies needed to advance cyanobacteria as chassis for production of chemicals and fuels. 2019
- Analyse Biologischer Systeme: Von Datenmassen zum Modell. GIT Laborfachzeitschrift. 41-43. 2018
- SDS-PAGE fractionation to increase metaproteomic insight into the taxonomic and functional composition of microbial communities for biogas plant samples. Engineering in Life Sciences. 498-509. 2018
- Efficiency of RNA extraction from selected bacteria in the context of biogas production and metatranscriptomics. Anaerobe. 85-90. 2014
- Synthetische Biologie - Forscher wollen Lego. Chemie in Labor und Biotechnik. 296-309. 2013
- Bioinformatik und Synthetische Biologie - Oder: Wie modern soll moderner Biologieunterricht sein?. Praxis der Naturwissenschaften. 4-5. 2012
- Nutrilyzer: A Tool for Deciphering Atomic Stoichiometry of Differentially Expressed Paralogous Proteins.. Journal of Integrative Bioinformatics. 196. 2012
- Synthetische Biologie - Nichts Neues? Plädoyer für eine Auseinandersetzung im Unterricht. Praxis der Naturwissenschaften. 23-34. 2012
- Clustering approach to detect mRNA-degradation patterns from DNA–microarray gene-expression data. Biosystems & Information Technology. 5-13. 2012
- MAVisto: A Tool for Biological Network Motif Analysis. Bacterial Molecular Networks. 263-280. 2012
- Nutrilyzer: A Tool for Deciphering Atomic Stoichiometry of Differentially Expressed Paralogous Proteins. Journal of Integrative Bioinformatics. 46-52. 2012
- The LAILAPS Search Engine: Relevance Ranking in Life Science Databases. Journal of Integrative Bioinformatics. 2010
- An algorithmic approach to analyse genetic networks and biological energy production: an introduction and contribution where OR meets biology†. Optimization. 1-22. 2009
- Experimental and bioinformatic approaches for analyzing and visualizing cyanobacterial nitrogen and hydrogen metabolism. Electronic Journal of Biotechnology. 0-0. 2007
- An algorithm to analyze stability of gene-expression patterns. Discrete Applied Mathematics. 1140-1156. 2006
- Mathematical Modeling and Discrete Approximation in Evaluation and Forecasting of Expression-Data. Electronic Notes in Discrete Mathematics. 52-56. 2003
- Presence and expression of hydrogenase specific C-terminal endopeptidases in cyanobacteria. BMC Microbiology. 8. 2003
- Hydrogen in education?a biological approach. International Journal of Hydrogen Energy. 1131-1140. 2002
- Hydrogenases and Hydrogen Metabolism of Cyanobacteria. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 1-20. 2002
- Electron pathways involved in H 2 -metabolism in the green alga Scenedesmus obliquus. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics. 271-278. 2001
- Molecular Evidence for a Fe-Hydrogenase in the Green Alga Scenedesmus obliquus. Current Microbiology. 353-360. 2001
- Light dependent production of hydrogen gas by green algae. The future energy carrier in the classroom?. Journal of Biological Education. 214-217. 2000
- Redox control of hydrogenase activity in the green algaScenedesmus obliquusby thioredoxin and other thiols. FEBS Letters. 162-164. 1999
- Purification and Characterization of Cytochrome c6 from the Unicellular Green Alga Scenedesmus obliquus. Zeitschrift für Naturforschung C. 740-746. 1997
Konferenzpaper
- Entwicklung eines in silico SNP-Arrays zur Genotypisierung von Hunden. Tagungsband zur 23. Nachwuchswissenschaftler*innenkonferenz. Hrsg. Lohr, Thomas. 26-29. 2023
- Genetische Untersuchung von Apis mellifera hinsichtlich deren Toleranzeigenschaften bezüglich Varroamilben. Tagungsband zur 23. Nachwuchswissenschaftler*innenkonferenz. Hrsg. Lohr, Thomas. 22-25. 2023
- Evaluating the Influence of Agro-Environmental Measures on Honey Bees Based on Genetic Pollen Analysis With Nanopore Sequencing. Open Conference Proceedings. 201-203. 2022
- Development of a genetic biomonitoring test for the investigation of pollinator-plant-interactions. Scientific Reports 2021, Ökologische Transformation in Technik, Wirtschaft und Gesellschaft?. 244-247. 2021
- Which pollen do bees like best? - Analysis of mixed pollen samples with metabarcoding. Scientific Reports 2021, Ökologische Transformation in Technik, Wirtschaft und Gesellschaft?. 248-252. 2021
Konferenzposter
Monographie
- Allgemeinbildung Gene, Genetik und Gentechnik für Dummies 2022
- Genes, Genomes and Society 2022
- Genetic Engineering 2021
- Generation Gen-Schere 2019
- Gentechnik 2019
- Wiley-Schnellkurs Bioinformatik Datenmassen richtig fassen 2016
- Computational Biology: A Practical Introduction to BioData Processing & Analysis with Linux, MySQL, and R 2013
- Computational Biology 2013
- Computational Biology - eine Einführung: Datenbanken, Linux, Bioperl & Co .... Biologie in unserer Zeit. 90-99. 2005
- Computational Biology: Unix/Linux, Data Processing and Programming 2004
- Computational Biology 2004
Sammelbandbeitrag
- DNA-Sequenzierung in der dritten Generation: Von den Anfängen der Sequenziertechnik bis zu Nanoporen. Chemie in Labor und Biotechnik. 324-335. 2020
- Ein Lehrmeister war das Immunsystem. Chemie in Labor und Biotechnik. 130-143. 2020
- Über die Modernisierung des Menschen. Modernes Leben – Leben in der Moderne. 123-145. 2017
- Making-of Synthetic Biology:  The European CyanoFactory Research Consortium. Ambivalences of Creating Life. Societal and Philosophical Dimensions of Synthetic Biology. 55-72. 2016
- Making-of Synthetic Biology: The European CyanoFactory Research Consortium. Ethics of Science and Technology Assessment. 55-72. 2016
- CyanoFactory Knowledge Base & Synthetic Biology: A Plea for Human Curated Bio-databases. 6th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms. 237-242. 2015
- CyanoFactory Knowledge Base - A web-based tool for analysis and visualization of experimental data. Tagungsband der 16. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz. 187-191. 2015
- Protein Interaction Network Analysis and Visualization of Synechocystis sp. PCC 6803. Tagungsband der 16. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz. 257-261. 2015
- Re-Sequencing Rhodobacter sphaeroides strain 2.4.1 to facilitate understanding of varying hydrogen evolution rates. Tagungsband der 16. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz. 262-267. 2015
- A Clustering Approach to Detect mRNA-Degradation Patterns from DNA-Microarray Gene-Expression Data. Biosystems & Information Technology. 6-13. 2012
- Carbohydrate Metabolism and Citrate Cycle; Amino Acids and Derivatives; Lipids and Glycolipids; Steroids and Isoprenoids; Nucleotides and Nucleosides; Protein Biosynthesis in Eukarya; Posttranslational Modification of Proteins. Biochemical Pathways. 2012
- Determination of the equilibration concentrations of substances during recirculation of process water in anaerobic digestion plants.. 13. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz mitteldeutscher Fachhochschulen. 293-298. 2012
- Von den Gebeinen Lucys zu dem Genom des Neandertalers. Evolutionsbiologie. 405-459. 2011
- Light-Dependent Hydrogen Production of the Green Alga Scenedesmus obliquus. BioHydrogen. 243-251. 1998
- Photohydrogen Production - Hydrogenases in the Green Alga Scenedesmus Obliquus. Photosynthesis: Mechanisms and Effects. 1951-1954. 1998
- INVESTIGATIONS TO APPLY BIOLOGICALLY PRODUCED PHOTOHYDROGEN AS A FUTURE ENERGY SOURCE. Biomass for Energy and the Environment. 1668-1673. 1996

Organisation von Veranstaltungen

1. Fachtag der Bienengesundheit 2022
CRISPR und DNA-Sequenzierung 2022
Schafpudel Workshop – Stand der Forschung 2022
Tagungsgruppe "Biologische Systeme verstehen" 2021
Tag der Biodiversität 2019

Präsentationen auf Veranstaltungen

Raus aus dem Labor, hinein ins Leben. Wie neue Techniken unser Erbgut gläsern und antastbar machen, Sprecher, während Humpis Montagsforums 2022
Genmarker-gestützte Bienenzucht, Sprecher, während 1. Fachtag der Bienengesundheit 2022
Genscheren und Nanoporen im Sek. II Unterricht, Sprecher, CRISPR und DNA-Sequenzierung 2022
CRISPRevolution – Neue Dimensionen der Gentechnik, Sprecher, CRISPRevolution - Neue Dimension der Gentechnik 2022
Neue Gentechniken, Sprecher, NABU-Bundesfachausschusses Umweltchemie und Ökotoxikologie 2022
Schafpudel: Science/Breeding/Media, Sprecher, Schafpudel Workshop – Stand der Forschung 2022
Biolügie, Sprecher, während 5. Öffentliche Ringvorlesung, Hochschule Mittweida 2021
From bees to bioweapons and AWK to R, Sprecher, University of Ljubljani, Faculty of Chemistry and Chemical Technology 2021
DNA Analysis in MW, Sprecher, während 26. Interdisziplinäre Wissenschaftliche Konferenz Mittweida 2021
Die Genschere CRISPR/Cas in Natur und Technik, Sprecher, während Bundesweite Netzwerktagung der biotechnologischen Gymnasien 2021
Egoistische Gene, böse Technik, oder was?, vortragende Person, während 4. Öffentliche Ringvorlesung, Hochschule Mittweida 2018
From Computational to Synthetic Biology, vortragende Person, während SynbioDay – Infotag der Synthetischen Biologie, Düsseldorf 2017
Gene, Genome, Genies, vortragende Person, während LernCamp des gymnasialen Netzwerks zur individuellen Förderung besonders begabter Schülerinnen und Schüler (GIFted) Auerbach 2017
Nonlinear Life from an Biological Point of View, vortragende Person, während Summer School "Nonlinear Life", Riga 2017
Umwelt - Dritte Welt - Eine Welt, vortragende Person, während Tag der Wissenschaften, Berufliches Schulzentrum für Gastgewerbe Dresden 2017
Wir müssen reden! Über Züchtung - beim Menschen! , vortragende Person, während Nacht der Wissenschaften, Hochschule Mittweida 2017
Woher kommt der Strom aus der Steckdose?, vortragende Person, KinderUni der Hochschule Mittweida 2017
Choice from Noise - Modelling Biology, ModeratorIn, während Integration of Expert Knowledge for Interpretable Models in Biomedical Data Analysis Dagstuhl 2016
Grüne Gentechnik: Teufelswerk oder ethisches Gebot?, ModeratorIn, während Podiumsdiskussion, veranstaltet von der Kreisvolkshochschule Harz und der Ev. Kirchengemeinde Quedlinburg 2016
Alle Menschen sind gleich, oder?, vortragende Person, während LernCamp des gymnasialen Netzwerks zur individuellen Förderung besonders begabter Schülerinnen und Schüler (GIFted) Auerbach 2016
Kinder nach Maß - neue Möglichkeiten der Fortpflanzungsmedizin, vortragende Person, während 3. Öffentliche Ringvorlesung, Hochschule Mittweida 2016
Kinderwunsch - Wunschkinder. Wie aus Liebe Reproduktion wird., vortragende Person, während Tag der Wissenschaften, Berufliches Schulzentrum für Gastgewerbe Dresden 2016
Neue Gene ohne Technik? Über Dinge, die wir tun und lassen können., vortragende Person, während Bürgerakademie Hochschule Mittweida 2016
Transcriptome Analysis Of Hydrogen Producing Rhodobacter Spheroids 2.4.1, vortragende Person, während 17. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz 2016 Hochschule Schmalkalden/Germany 2016
Wie Biotechnologie und die Neandertaler unsere Zukunft präg(t)en, vortragende Person, während Nacht der Wissenschaften, Hochschule Mittweida 2016
Algen machen Spass - und geben Gas, vortragende Person, während Ehrenkolloquium zum Tod von Professor Horst Senger Marburg 2015
Biotechnologie im Lichte von Ebola, vortragende Person, während Nacht der Wissenschaften, Hochschule Mittweida 2015
Biotechnologie im Zeitalter von BigData, vortragende Person, während Bundesweite Netzwerktagung der biotechnologischen Gymnasien Mittweida 2015
Computer gegen Viren, vortragende Person, während LernCamp des gymnasialen Netzwerks zur individuellen Förderung besonders begabter Schülerinnen und Schüler (GIFted) Auerbach 2015
Warum werden die Blätter im Herbst bunt?, vortragende Person, KinderUni der Hochschule Mittweida 2015

betreut/e wissenschaftliche Arbeit

Promotion
- Genombasierten Analyse von Mikroorganismen in Bioaerosolen bearbeitet durch Leidenfrost, Robert 2017 - 2023
- Omic-basierte Prozessoptimierung der lichtgetriebenen Wasserstofferzeugung mit Rhodobacter sphaeroides bearbeitet durch Wappler, Nadine 2015 -
- Design and implementation of a web-based knowledge base and modelling software for prokaryotes bearbeitet durch Kind, Gabriel 2014 -
- Analyse des Metatranskriptoms in Biogasanlagen bearbeitet durch Stark, Lucy 2012 -

Weitere Projekte

Analyse des Metatranskriptoms in Biogasfermentern

ORCID iD

https://orcid.org/0000-0002-2824-4707 (bestätigt)

vollständiger Name

Röbbe Wünschiers

Raum

6-130

Besucheradresse

Am Schwanenteich 4b

Mittweida

09648

Postadresse

Technikumplatz 17

Mittweida

09648

Deutschland

KoautorInnen-Netzwerk

Koforscher-Netzwerk

Kontaktdaten

wuenschi@hs-mittweida.de

+49 3727 582220

Webseiten

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