Wünschiers, Röbbe

Prof. Dr. rer. nat. habil.

Positionen

Professor, Fachgruppe Biotechnologie und Chemie, Fakultät Angewandte Computer- und Biowissenschaften

Überblick

I love processing of biological data with AWK. Hence, you can find me in the Web under awkologist.com and in Instagram as the.awkologist.

Übersicht zur Forschung

- Elucidation of ecological networks by pollen DNA analysis
- Analysis of bee health based on landscape diversity and agricultural practices
- Support of varroa-resistant bee breeding with genomic diagnostics
- Development of a gene-test for chryptorchidism in dogs
- Engineering of an efficient hydrogen-producing bacterial chassis by gene editing

Forschungsschwerpunkt

Produkt- und Prozessentwicklung Forschungsschwerpunkt

Projektleitung für

Leitung von

Klassifikationssicherheit in angewandten Computer- und Biowissenschaften gefördert von Sächsisches Staatsministerium für Wissenschaft, Kultur und Tourismus 2015 - 2016

ausgewählte Veröffentlichungen

Beitrag in nicht-wissenschaftlichen Medien
- Die genetische Diversität von Ökosystemen erfassen. ZEIT ONLINE. 2022
Journalartikel
- Analysis of a σ54 Transcription Factor L420P Mutation in Context of Increased Organic Nitrogen Tolerance of Photofermentative Hydrogen Production in Cereibacter sphaeroides Strain 2.4.1 Substrain H2. Synthetic Biology and Engineering. 2024
- CRISPR/Cas9 gene targeting plus nanopore DNA sequencing with the plasmid pBR322 in the classroom. Journal of Microbiology & Biology Education. 2024
- A primer on pollen assignment by nanopore-based DNA sequencing. Frontiers in Ecology and Evolution. 2023
- Testing assembly strategies of Francisella tularensis genomes to infer an evolutionary conservation analysis of genomic structures. BMC Genomics. 822. 2021
- Analyzing the Dietary Diary of Bumble Bee. Frontiers in Plant Science. 2020
- Benchmarking the MinION: Evaluating long reads for microbial profiling. Scientific Reports. 5125. 2020
- Draft Genome Assembly of Rhodobacter sphaeroides 2.4.1 Substrain H2 from Nanopore Data. Microbiology Resource Announcements. 2020
- Using ITS2 metabarcoding and microscopy to analyse shifts in pollen diets of honey bees and bumble bees along a mass‐flowering crop gradient. Molecular Ecology. 5003-5018. 2020
- CyanoFactory, a European consortium to develop technologies needed to advance cyanobacteria as chassis for production of chemicals and fuels. 2019
- Analyse Biologischer Systeme: Von Datenmassen zum Modell. GIT Laborfachzeitschrift. 41-43. 2018
- SDS-PAGE fractionation to increase metaproteomic insight into the taxonomic and functional composition of microbial communities for biogas plant samples. Engineering in Life Sciences. 498-509. 2018
- Efficiency of RNA extraction from selected bacteria in the context of biogas production and metatranscriptomics. Anaerobe. 85-90. 2014
- Synthetische Biologie - Forscher wollen Lego. Chemie in Labor und Biotechnik. 296-309. 2013
- Bioinformatik und Synthetische Biologie - Oder: Wie modern soll moderner Biologieunterricht sein?. Praxis der Naturwissenschaften. 4-5. 2012
- Nutrilyzer: A Tool for Deciphering Atomic Stoichiometry of Differentially Expressed Paralogous Proteins.. Journal of Integrative Bioinformatics. 196. 2012
- Synthetische Biologie - Nichts Neues? Plädoyer für eine Auseinandersetzung im Unterricht. Praxis der Naturwissenschaften. 23-34. 2012
- Clustering approach to detect mRNA-degradation patterns from DNA–microarray gene-expression data. Biosystems & Information Technology. 5-13. 2012
- MAVisto: A Tool for Biological Network Motif Analysis. Bacterial Molecular Networks. 263-280. 2012
- Nutrilyzer: A Tool for Deciphering Atomic Stoichiometry of Differentially Expressed Paralogous Proteins. Journal of Integrative Bioinformatics. 46-52. 2012
- The LAILAPS Search Engine: Relevance Ranking in Life Science Databases. Journal of Integrative Bioinformatics. 2010
- An algorithmic approach to analyse genetic networks and biological energy production: an introduction and contribution where OR meets biology†. Optimization. 1-22. 2009
- Experimental and bioinformatic approaches for analyzing and visualizing cyanobacterial nitrogen and hydrogen metabolism. Electronic Journal of Biotechnology. 0-0. 2007
- An algorithm to analyze stability of gene-expression patterns. Discrete Applied Mathematics. 1140-1156. 2006
- Mathematical Modeling and Discrete Approximation in Evaluation and Forecasting of Expression-Data. Electronic Notes in Discrete Mathematics. 52-56. 2003
- Presence and expression of hydrogenase specific C-terminal endopeptidases in cyanobacteria. BMC Microbiology. 8. 2003
- Hydrogen in education?a biological approach. International Journal of Hydrogen Energy. 1131-1140. 2002
- Hydrogenases and Hydrogen Metabolism of Cyanobacteria. Microbiology and Molecular Biology Reviews. 1-20. 2002
- Electron pathways involved in H 2 -metabolism in the green alga Scenedesmus obliquus. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics. 271-278. 2001
- Molecular Evidence for a Fe-Hydrogenase in the Green Alga Scenedesmus obliquus. Current Microbiology. 353-360. 2001
- Light dependent production of hydrogen gas by green algae. The future energy carrier in the classroom?. Journal of Biological Education. 214-217. 2000
- Redox control of hydrogenase activity in the green algaScenedesmus obliquusby thioredoxin and other thiols. FEBS Letters. 162-164. 1999
- Purification and Characterization of Cytochrome c6 from the Unicellular Green Alga Scenedesmus obliquus. Zeitschrift für Naturforschung C. 740-746. 1997
Konferenzpaper
- Entwicklung eines in silico SNP-Arrays zur Genotypisierung von Hunden. Tagungsband zur 23. Nachwuchswissenschaftler*innenkonferenz. Hrsg. Lohr, Thomas. 26-29. 2023
- Genetische Untersuchung von Apis mellifera hinsichtlich deren Toleranzeigenschaften bezüglich Varroamilben. Tagungsband zur 23. Nachwuchswissenschaftler*innenkonferenz. Hrsg. Lohr, Thomas. 22-25. 2023
- Evaluating the Influence of Agro-Environmental Measures on Honey Bees Based on Genetic Pollen Analysis With Nanopore Sequencing. Open Conference Proceedings. 201-203. 2022
- Development of a genetic biomonitoring test for the investigation of pollinator-plant-interactions. Scientific Reports 2021, Ökologische Transformation in Technik, Wirtschaft und Gesellschaft?. 244-247. 2021
- Which pollen do bees like best? - Analysis of mixed pollen samples with metabarcoding. Scientific Reports 2021, Ökologische Transformation in Technik, Wirtschaft und Gesellschaft?. 248-252. 2021
Konferenzposter
Monographie
- Allgemeinbildung Gene, Genetik und Gentechnik für Dummies 2022
- Genes, Genomes and Society 2022
- Genetic Engineering 2021
- Generation Gen-Schere 2019
- Gentechnik 2019
- Wiley-Schnellkurs Bioinformatik Datenmassen richtig fassen 2016
- Computational Biology: A Practical Introduction to BioData Processing & Analysis with Linux, MySQL, and R 2013
- Computational Biology 2013
- Computational Biology - eine Einführung: Datenbanken, Linux, Bioperl & Co .... Biologie in unserer Zeit. 90-99. 2005
- Computational Biology: Unix/Linux, Data Processing and Programming 2004
- Computational Biology 2004
Sammelbandbeitrag
- DNA-Sequenzierung in der dritten Generation: Von den Anfängen der Sequenziertechnik bis zu Nanoporen. Chemie in Labor und Biotechnik. 324-335. 2020
- Ein Lehrmeister war das Immunsystem. Chemie in Labor und Biotechnik. 130-143. 2020
- Über die Modernisierung des Menschen. Modernes Leben – Leben in der Moderne. 123-145. 2017
- Making-of Synthetic Biology:  The European CyanoFactory Research Consortium. Ambivalences of Creating Life. Societal and Philosophical Dimensions of Synthetic Biology. 55-72. 2016
- Making-of Synthetic Biology: The European CyanoFactory Research Consortium. Ethics of Science and Technology Assessment. 55-72. 2016
- CyanoFactory Knowledge Base & Synthetic Biology: A Plea for Human Curated Bio-databases. 6th International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms. 237-242. 2015
- CyanoFactory Knowledge Base - A web-based tool for analysis and visualization of experimental data. Tagungsband der 16. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz. 187-191. 2015
- Protein Interaction Network Analysis and Visualization of Synechocystis sp. PCC 6803. Tagungsband der 16. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz. 257-261. 2015
- Re-Sequencing Rhodobacter sphaeroides strain 2.4.1 to facilitate understanding of varying hydrogen evolution rates. Tagungsband der 16. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz. 262-267. 2015
- A Clustering Approach to Detect mRNA-Degradation Patterns from DNA-Microarray Gene-Expression Data. Biosystems & Information Technology. 6-13. 2012
- Carbohydrate Metabolism and Citrate Cycle; Amino Acids and Derivatives; Lipids and Glycolipids; Steroids and Isoprenoids; Nucleotides and Nucleosides; Protein Biosynthesis in Eukarya; Posttranslational Modification of Proteins. Biochemical Pathways. 2012
- Determination of the equilibration concentrations of substances during recirculation of process water in anaerobic digestion plants.. 13. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz mitteldeutscher Fachhochschulen. 293-298. 2012
- Von den Gebeinen Lucys zu dem Genom des Neandertalers. Evolutionsbiologie. 405-459. 2011
- Light-Dependent Hydrogen Production of the Green Alga Scenedesmus obliquus. BioHydrogen. 243-251. 1998
- Photohydrogen Production - Hydrogenases in the Green Alga Scenedesmus Obliquus. Photosynthesis: Mechanisms and Effects. 1951-1954. 1998
- INVESTIGATIONS TO APPLY BIOLOGICALLY PRODUCED PHOTOHYDROGEN AS A FUTURE ENERGY SOURCE. Biomass for Energy and the Environment. 1668-1673. 1996

Ausrichter des Events

1. Fachtag der Bienengesundheit 2022
CRISPR und DNA-Sequenzierung 2022
Schafpudel Workshop – Stand der Forschung 2022
Tagungsgruppe "Biologische Systeme verstehen" 2021
Tag der Biodiversität 2019

Präsentationen

Besprechung
- Neue Gentechniken, Sprecher, NABU-Bundesfachausschusses Umweltchemie und Ökotoxikologie 2022
Gastvortrag
- From bees to bioweapons and AWK to R, Sprecher, University of Ljubljani, Faculty of Chemistry and Chemical Technology 2021
- Die Genschere CRISPR/Cas in Natur und Technik, Sprecher, während Bundesweite Netzwerktagung der biotechnologischen Gymnasien 2021
Vortrag
- Raus aus dem Labor, hinein ins Leben. Wie neue Techniken unser Erbgut gläsern und antastbar machen, Sprecher, während Humpis Montagsforums 2022
- Genmarker-gestützte Bienenzucht, Sprecher, während 1. Fachtag der Bienengesundheit 2022
- Genscheren und Nanoporen im Sek. II Unterricht, Sprecher, CRISPR und DNA-Sequenzierung 2022
- CRISPRevolution – Neue Dimensionen der Gentechnik, Sprecher, CRISPRevolution - Neue Dimension der Gentechnik 2022
- Schafpudel: Science/Breeding/Media, Sprecher, Schafpudel Workshop – Stand der Forschung 2022
- Biolügie, Sprecher, während 5. Öffentliche Ringvorlesung, Hochschule Mittweida 2021
- DNA Analysis in MW, Sprecher, während 26. Interdisziplinäre Wissenschaftliche Konferenz Mittweida 2021
- Egoistische Gene, böse Technik, oder was?, vortragende Person, während 4. Öffentliche Ringvorlesung, Hochschule Mittweida 2018
- From Computational to Synthetic Biology, vortragende Person, während SynbioDay – Infotag der Synthetischen Biologie, Düsseldorf 2017
- Gene, Genome, Genies, vortragende Person, während LernCamp des gymnasialen Netzwerks zur individuellen Förderung besonders begabter Schülerinnen und Schüler (GIFted) Auerbach 2017
- Nonlinear Life from an Biological Point of View, vortragende Person, während Summer School "Nonlinear Life", Riga 2017
- Umwelt - Dritte Welt - Eine Welt, vortragende Person, während Tag der Wissenschaften, Berufliches Schulzentrum für Gastgewerbe Dresden 2017
- Wir müssen reden! Über Züchtung - beim Menschen! , vortragende Person, Nacht der Wissenschaften, Hochschule Mittweida 2017
- Woher kommt der Strom aus der Steckdose?, vortragende Person, KinderUni der Hochschule Mittweida 2017
- Choice from Noise - Modelling Biology, ModeratorIn, während Integration of Expert Knowledge for Interpretable Models in Biomedical Data Analysis Dagstuhl 2016
- Grüne Gentechnik: Teufelswerk oder ethisches Gebot?, ModeratorIn, während Podiumsdiskussion, veranstaltet von der Kreisvolkshochschule Harz und der Ev. Kirchengemeinde Quedlinburg 2016
- Alle Menschen sind gleich, oder?, vortragende Person, während LernCamp des gymnasialen Netzwerks zur individuellen Förderung besonders begabter Schülerinnen und Schüler (GIFted) Auerbach 2016
- Kinder nach Maß - neue Möglichkeiten der Fortpflanzungsmedizin, vortragende Person, während 3. Öffentliche Ringvorlesung, Hochschule Mittweida 2016
- Kinderwunsch - Wunschkinder. Wie aus Liebe Reproduktion wird., vortragende Person, während Tag der Wissenschaften, Berufliches Schulzentrum für Gastgewerbe Dresden 2016
- Neue Gene ohne Technik? Über Dinge, die wir tun und lassen können., vortragende Person, während Bürgerakademie Hochschule Mittweida 2016
- Transcriptome Analysis Of Hydrogen Producing Rhodobacter Spheroids 2.4.1, vortragende Person, während 17. Nachwuchswissenschaftlerkonferenz 2016 Hochschule Schmalkalden/Germany 2016
- Wie Biotechnologie und die Neandertaler unsere Zukunft präg(t)en, vortragende Person, Nacht der Wissenschaften, Hochschule Mittweida 2016
- Algen machen Spass - und geben Gas, vortragende Person, während Ehrenkolloquium zum Tod von Professor Horst Senger Marburg 2015
- Biotechnologie im Lichte von Ebola, vortragende Person, Nacht der Wissenschaften, Hochschule Mittweida 2015
- Biotechnologie im Zeitalter von BigData, vortragende Person, während Bundesweite Netzwerktagung der biotechnologischen Gymnasien Mittweida 2015
- Computer gegen Viren, vortragende Person, während LernCamp des gymnasialen Netzwerks zur individuellen Förderung besonders begabter Schülerinnen und Schüler (GIFted) Auerbach 2015
- Warum werden die Blätter im Herbst bunt?, vortragende Person, KinderUni der Hochschule Mittweida 2015

betreut/e wissenschaftliche Arbeit

Promotion
- Ciao Varroa – Genomweite genetische Assoziationsstudien bei Honigbienen (Apis mellifera spp.) in Hinblick auf die Varroaresistenzzucht bearbeitet durch Schmidt, Tom 2024 -
- Health status of solitary wild bees in relation to landscape diversity, farming practices and pollen diet bearbeitet durch Prudnikow, Lisa Carolina 2023 -
- Assemblierung des Schafpudel-Genoms und genomweite Assoziationsstudien zu Kryptorchismus mit dem Ziel der Entwicklung eines Testverfahrens bearbeitet durch Schön, Nils 2023 -
- Development of Methods for the Genomic Analysis of Microorganisms in Bioaerosols bearbeitet durch Leidenfrost, Robert 2017 - 2023
- Molekularbiologische und physiologische Untersuchungen zur Prozessoptimierung der lichtgetriebenen Wasserstofferzeugung mit Rhodobacter sphaeroides bearbeitet durch Wappler, Nadine 2015 - 2021

andere Forschungsaktivitäten

Analyse des Metatranskriptoms in Biogasfermentern

hat Großgeräte

Magnetic Inclution Cycler

ORCID iD

https://orcid.org/0000-0002-2824-4707 (bestätigt)

vollständiger Name

Röbbe Wünschiers

zugehörig zur Einrichtung

6-130

Postanschrift

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Mittweida

09648

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Mittweida

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